Freud ja ahneet anjovikset on mielikuvituksellinen lastenseikkailu, jossa unitohtori Freud ja hänen ystävänsä purjehtivat viikinkilaivalla kohti jännittäviä yllätyksiä. Sateisten autiosaarten, uniaasien ja lentävien purjelaivojen keskellä joukko löytää sirkuskorun ja he päätyvät etsimään sirkusmaskotti Piikkikorvaa Kanasirkuksen sokkeloisiin kulisseihin.
Matkalla tavataan höpsy ruokarobotti Ding, hattaroita janoava lohikäärme Tuure Tupraus, iloinen varaani Hyppivä Huuli sekä lukuisa joukko sirkuksen omituisia, suloisia ja ilkikurisia asujia. Kun sirkusesitys on vaarassa ja koko sirkus kaaoksen partaalla, ystävykset ryhtyvät pelastamaan tilannetta – ja löytävät jotain, mitä eivät osanneet odottaa: suuren annoksen rakkautta ja yhteenkuuluvuutta.