Veljekset Edward ja Alphonse Elric hallitsevat alkemian - taidon, jonka avulla aineita voi muuttaa toisiksi. Etenkin Edward tunnetaan alan nerona, yhtenä valtion virallisista alkemisteista. Hänen tittelinsä on "Fullmetal Alchemist", Teräsalkemisti.
Alphonse ylittää vuoren lumipyryssä kantaen mukanaan tärkeää viestiä. Samaan aikaan Ed joutuu turvautumaan vihollisten apuun. Mutta kehen voi enää luottaa, kun sotaa käydään joka rintamalla?