Veljekset Edward ja Alphonse Elric hallitsevat alkemian - taidon, jonka avulla aineita voi muuttaa toisiksi. Etenkin Edward tunnetaan alan nerona, yhtenä valtion virallisista alkemisteista. Hänen tittelinsä on "Fullmetal Alchemist", Teräsalkemisti.
Samaan aikaan kun Mei matkaa ovela homunculus Envy mukanaan kotimaahansa saa Al kuulla Edin katoamisesta. Luvassa on kuitenkin yllättäviä perhekohtaamisia, kun Al ja veljesten isä tapaavat vuosien jälkeen. Ja isällä on uskomatonta kerrottavaa...