Veljekset Edward ja Alphonse Elric hallitsevat alkemian - taidon, jonka avulla aineita voi muuttaa toisiksi. Etenkin Edward tunnetaan alan nerona, yhtenä valtion virallisista alkemisteista. Hänen tittelinsä on "Fullmetal Alchemist", Teräsalkemisti.
Ed, Al ja Winry palaavat Keskukseen ja saavat kuulla, että Maes Hughes on murhattu. Pääepäiltynä on vangittu eräs armeijan jäsen, mutta paljastuuko todellinen syyllinen?