Ihmiselle on ominaista antaa ympäröivälle todellisuudelle merkityksiä. Sekä uskonnot että tieteellinen tutkimus tarjoavat ihmistä kiinnostaville asioille ja ilmiöille selityksiä, jotka toisinaan ovat joutuneet konfliktiin keskenään. Esimerkiksi maakeskeisestä maailmankuvasta luopuminen ja ihmiskeskeisen evoluutioajattelun synty ovat haastaneet ihmistä arvioimaan paitsi tieteellistä tietoa, myös uskonnollisia käsityksiään uudessa valossa. Tietoisuuden ongelma ja metafysiikkaan liittyvät kysymykset puolestaan asettavat haasteita modernin luonnontieteen selitysmalleille.
Uskonnon ja luonnontieteiden välinen suhde voidaan yhtäältä hahmottaa keskittymällä esimerkiksi kristittyjen ja muslimien asenteisiin tieteellistä tutkimusta kohtaan. Toisaalta uskonnot ja ihminen itsessään voidaan nähdä tutkimuksen kohteena. Tällöin kiinnitetään huomiota esimerkiksi siihen, millaiset uskomukset ovat ihmiselle luontevia tai miten ihminen eroaa eläimistä. Ihminen, uskonto ja luonnontieteet tarjoaa monitieteisen lähestymistavan näihin kysymyksiin.