Raamattu ei kerro mitään Jeesus Nasaretilaisen nuoruusvuosista. Jotakin hänen ja elämänpiirinsä tapahtumista voidaan päätellä takautuvasti hänen toimintansa ja opetustensa perusteella. Siinä Nuori Herra Nasaret -romaanin punainen lanka.
Toinen tämän tarinan kirjoittamiseen innostaneista havainnoista oli vain vähän käsitelty seikka, että koska Jeesus ja Johannes (Kastaja) olivat paitsi sukulaisia ja melkein samanikäisiä, heidän voi olettaa tunteneen toisensa lapsesta asti. Tässä tarinassa heidän kasvunsa juutalaisuudessa nivoutuu yhteen vaikkakin jo poikasina heidän ajatuksensa synnistä ja lain täyttämisestä eroavat jyrkästi toisistaan.
Roomalainen kohortti tuhosi Seforiksen kaupungin Nasaretin läheltä. Siellä Jeesus tapaa remonttityömaalla velipuolensa sekä traagisen tapah-tuman jälkeen prostituoidun Magdalan Marian, joka rakastuu Jeesukseen miehenä ja hengenheimolaisena.
Lehtimajajuhlilla Jeesus kuulee Johanneksen toteuttaneen suunnitelmansa muuttaa Qumraniin ja liittyä tiukan linjan lakiuskovaisiin. Hän houkuttelee sinne myös Jeesusta.
Jeesuksen kahdeksan vuotta nuorempi sisko Saara tulee raiskatuksi. Tämä tapaus nostaa tarkasteluun vihaamisen, kostamisen ja anteeksiantamisen teemoja. Magdalan Maria antaa omiin raskaisiin kokemuksiinsa perustuen Saaran itsetuntoa palauttavaa keskusteluhoitoa. Dilemma naisen oikeudesta koskemattomuuteensa avautuu syvältä kouraisevan ikiaikaisena.
Vaarallisella vaelluksella Johanneksen kanssa Galileasta kotiin Saara loukkaa itsensä ja saatuaan Johannekselta ensiavun pyrkii varmistumaan vetovoimastaan naisena. Saara saa Johanneksen myös ajattelemaan Qumranin jättämistä, Johannes puolestaan Saaran luottamaan mahdollisuuksiinsa naisena.