Herttainen Tokyo Mew Mew tarjoaa romantiikkaa, seikkailua ja avaruusolentojen juonia.
Avaruusolennot on kukistettu ja Tokioon on jälleen palannut rauha - vai onko sittenkään? Salaperäinen St. Rose Crusaders -järjestö hautoo jotakin ikävää... Uuden koulun aloittava Berry-tyttö eksyy MewMew-kahvilaan ja joutuu eriskummallisten tapahtumien pyörteisiin. Pian viuhuu oikeuden käpälä!